Z charakteru prawnego opłaty skarbowej od zaświadczenia wynika, że jest to danina publicznoprawna, charakteryzująca się cechami podobnymi do podatków i ceł. Z tym jednak, że w przeciwieństwie do podatków i ceł, jest świadczeniem odpłatnym, co oznacza, że jest związana z wzajemnym obliczalnym i konkretnym świadczeniem ze strony państwa, czyli z ekwiwalentem. Wartość opłaty skarbowej nie jest związana z wartością towaru, a stanowi koszt czynności dokonanej przez organ.
Pamiętajmy, że obowiązek zapłaty opłaty skarbowej ciąży każdorazowo na osobach fizycznych, osobach prawnych i jednostkach organizacyjnych niemających osobowości prawnej, jeżeli wskutek dokonanego przez nie zgłoszenia lub na ich wniosek dokonuje się czynności urzędowej, albo jeżeli na ich wniosek wydaje się zaświadczenie lub zezwolenie (pozwolenie, koncesję), a w przypadku złożenia dokumentu stwierdzającego udzielenie pełnomocnictwa lub prokury albo jego odpisu, wypisu lub kopii – na mocodawcy, pełnomocniku, przedsiębiorcy lub prokurencie. Obowiązek zapłaty opłaty skarbowej ciąży solidarnie na osobach lub jednostkach wymienionych powyżej, jeżeli w wyniku złożonego wspólnie zgłoszenia lub na ich wspólny wniosek dokonuje się czynności urzędowej lub na ich wspólny wniosek wydaje się zaświadczenie lub zezwolenie (pozwolenie, koncesję) a w przypadku złożenia dokumentu stwierdzającego udzielenie pełnomocnictwa lub prokury albo jego odpisu, wypisu lub kopii – na mocodawcy i pełnomocniku lub przedsiębiorcy i prokurencie.
Jeżeli jednak jedną ze stron solidarnej czynności prawnej jest osoba fizyczna, osoba prawna lub jednostka organizacyjna niemająca osobowości prawnej zwolniona od opłaty skarbowej, obowiązek zapłaty opłaty skarbowej ciąży solidarnie na pozostałych stronach tej czynności.
Wykaz przedmiotów opłaty skarbowej, stawki tej opłaty oraz zwolnienia możemy odnaleźć w załączniku do omawianej ustawy. W 2013 r. zmianie uległy stawki opłaty skarbowej od środków ochrony roślin (wszystko przez zmiany w ustawie o nasiennictwie). W przypadku dokonywania wpisów do rejestru działalności regulowanej podmiotu wykonującego działalność na podstawie przepisów o środkach ochrony roślin w zakresie wprowadzania środków ochrony roślin do obrotu lub konfekcjonowania tych środków opłata została utrzymana na dotychczasowym poziomie, czyli 1135 zł. To samo dotyczy stawki za wpis do rejestru w przypadku podmiotów prowadzących szkolenia w zakresie środków ochrony roślin – 616 zł. Nową wartością opłaty skarbowej jest już jednak wpis do rejestru podmiotów prowadzących działalność w zakresie badań sprawności technicznej sprzętu przeznaczonego do stosowania środków ochrony roślin przyjęto wysokość opłaty w kwocie – 220 zł.
Kolejną zmianą jest opłata skarbowa za czynności dokonywane w sprawie udzielenia upoważnienia do opracowywania ocen lub uwag w rozumieniu przepisów o środkach ochrony roślin w kwocie 1000 zł oraz opłaty za zmianę zakresu tego upoważnienia w kwocie 500 zł.
